本書收錄現在已成為柯南好搭檔的灰原哀首次登場時 的故事，還有與黑衣組織的琴酒等人的首次對決！ 灰原首次登場是在電視動畫的兩小時特別篇！ 隱藏真實身分並作為轉學生來到這裡的灰原， 與少年偵探團一起被捲入事件之中， 她與柯南兩人獨處時竟然…!? 然後，柯南和灰原將與琴酒等人進行首次對決！ 柯南和灰原得知黑衣組織的皮斯克策劃的暗殺計畫 並試圖阻止！同時，琴酒也察覺到情報外洩…!? 除了電視動畫第129集「來自黑衣組織的女子 大學教授殺人事件」正篇，以及第176～178集 「與黑衣組織的再會（灰原篇．柯南篇．解決篇）」 正篇，另外還收錄了製作花絮！